【区域位置】 肃南县地处河西走廊中部、祁连山北麓，位于北纬37°28'-39°04‘、东经97°20‘-102°13'，东临天祝藏族自治县，西接肃北蒙古族自治县，北部自东向西与凉州区、甘州区、肃州区、嘉峪关市、玉门市等市县区毗邻，南部与青海省祁连县、门源回族自治县等县相连，东西长650 多公里，南北宽120公里-200公里，总面积为23887平方公里。

【地形地貌】 县域地形狭长，地貌形态多样，地势起伏大，主要为中高山地、峡谷、洪积走廊平原，形成南部山地和北部走廊平原两大地貌单元。海拔1327米-5564米，平均海拔3200米，祁连山主峰素珠链及著名的“七一”冰川即在境内。

【气候】 肃南县属高寒半干旱气候，具有冬冷夏凉，夏雨多冬雪少，无霜期短，光热、风能资源丰富等特点。年平均气温4.2℃，自西北向东南呈递减趋势，变化范围在-3.0℃~8.0℃之间。年平均降水量267.1毫米，西北少东南多，变化范围在100毫米-500毫米之间。2024年总的气候特征是：气温偏高，降水正常。年平均气温5.5℃，较历年平均值高 1.0℃，属偏高年份；年极端最高温度31.1℃，出现在5月21日；年极端最低温度-22.9℃，出现在1月21日。年降水量312.3毫米，较历年值多15%，属正常年份。全年日照总时数2497.3小时，较历年值少330.6小时。出现大雨4次、连阴雨2次、扬沙8次、浮尘18次、大风3次、强降温3次、寒潮1次。

【自然资源】 县域内自然资源富集，有丰富的煤炭、铜、铁、钨、铬、锰等矿产资源，被列为国家12个找矿重点区带之一，也是甘肃省黑色、有色金属矿产的集中区，具有巨大的矿产资源开发利用潜力。地表水资源丰富，三大内陆河黑河、石羊河、疏勒河及其30多条支流流经和发源于肃南山区，总流域面积2.15万平方公里，年出境水流量达到43.11亿立方米，水能蕴藏量为204.07万千瓦，有较大的水能开发潜力；境内有冰川964处，冰川总储量159.15亿立方米，成为河流的主要补给源，大气降水和冰雪融水下渗形成丰富的地下水，为河西5市及内蒙古西部400多万人口、1050万亩农田和数百家工矿企业提供生产生活用水，堪称甘肃河西和内蒙古西部的“生命线”和“绿色水塔”，是我国西部重要的生态安全屏障和物种基因库，也是河西内陆河流域绿洲经济社会发展的承载区。